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Projekt

FIJI-Plugin für IKOSA-Plattform

Masterprojekt

Die IKOSA-Plattform der KML Vision GmbH bietet ein breites Portfolio von KI-basierten Algorithmen für verschiedene Bildanalysen im Life Science Bereich. Die OSS (Open-Source-Software) ImageJ beziehungsweise FIJI findet in diesem Bereich breite Anwendung für bildbasierte Analysten.

Ziele

Ziel des Projekts war es, das bestehende IKOSA-Plugin für Fiji / ImageJ um folgende Funktionen zu erweitern, welche die Analysen mit IKOSA effizienter und user:innenfreundlicher machen:

  • Auswahl von bestimmten Bildbereichen, den sogenannten „Regions of Interest“ (ROIs) in Fiji, um darauf gezielte IKOSA-Analysen zu starten
  • Visualisierung von Analyseresultaten verschiedenster Formate direkt in Fiji

Ergebnis

Das IKOSA FIJI-Plugin wurde um die Funktionalität der ROI-Analyse erweitert. Zudem wurde eine Funktionalität entwickelt, um die Analyseresultate direkt im Plugin anzeigen zu können. Die ROI-Analyse ermöglicht die Vorbereitung von Daten für die Entwicklung weiterer Bildanalyse-Algorithmen in IKOSA.

FIJI-Plugin für IKOSA-Plattform

IKOSA Plugin, ROI Auswahl und ROI Manager (© FH JOANNEUM / eHealth)

FIJI-Plugin für IKOSA-Plattform 1

Auswahl des ZIP-Verzeichnisses in IKOSA (© FH JOANNEUM / eHealth)

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